Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcniQ9Z2V9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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