Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Hdac6Q9Z2V5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Hdac6Q9Z2V5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Hdac6Q9Z2V5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdac6Q9Z2V5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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