Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms