Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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