Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms