Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms