Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms