Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms