Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms