Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnip1Q9WUU8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms