Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms