Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc1Q9QZF2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms