Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms