Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PnckQ9QYK9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PnckQ9QYK9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms