Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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