Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms