Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms