Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms