Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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