Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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