Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms