Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cngb3Q9JJZ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms