Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms