Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms