Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms