Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mkrn2Q9ERV1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn2Q9ERV1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms