Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ParvgQ9ERD8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvgQ9ERD8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms