Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfip11Q9ERA6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms