Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms