Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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