Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms