Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms