Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim23Q9DAL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms