Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph3bQ9DA80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms