Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms