Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms