Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Derl3Q9D8K3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms