Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ifi35Q9D8C4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ifi35Q9D8C4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ifi35Q9D8C4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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