Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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