Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PudpQ9D5U5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PudpQ9D5U5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PudpQ9D5U5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PudpQ9D5U5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PudpQ9D5U5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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