Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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