Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms