Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efhc2Q9D485 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms