Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms