Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Urm1Q9D2P4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Urm1Q9D2P4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms