Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2cQ9D1C1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms