Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms