Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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