Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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