Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms